En 2003, se creó una asociación no gubernamental “Asociación Protejamos Yaxhá”- (APY) para velar por la Protección y el adecuado manejo del Parque Nacional Yaxhá-Nakúm-Naranjo.

Inicialmente, la “Asociación Protejamos Yaxhá” acordó con la “Reserva Natural Privada Yaxhá”, obtener un permiso para la construcción de la Estación en la propiedad.

El primer aporte de contrapartida se obtuvo del FONACON (Fondo Nacional para la Conservación) para la construcción de una Estación Biológica de Investigación.

También, la “Asociación Protejamos Yaxhá” ha recibido un aporte de contrapartida del FOGUAMA (Fondo Guatemalteco del Medio Ambiente) que contribuyó aportando a la estación biológica, el equipo solar y el equipo de radio comunicaciones.

Propuestas han sido enviadas a el U.S. Fish & Wildlife Service -USFWS- para el estudio de aves migratorias y al Gobierno de los Países Bajos para la conservación y el manejo de humedales en el área.

El trámite para la construcción de la Estación de Investigación empezó en mayo 2004, con la elaboración del Estudio de Impacto Ambiental.

En un principio tendrá capacidad para hospedar a 20 investigadores en dos construcciones típicas de la zona, teniendo un sistema de energía solar para electricidad y para las instalaciones de agua.